明治維新までは近くにある宇治神社と、二社一体でした。宇治上神社を離宮上社・宇治神社を離宮下社と、呼ばれていました。 拝殿（国宝）は、鎌倉時代前期に伐採された桧を使用した鎌倉時代の優れた建物遺構です。 本殿（国宝）は、平安時代後期に伐採された木材が使われています。 拝殿・本殿とも神社建築としては、日本最古の建物です。